Iván.
Seguramente existen formas de realizar lo que necesitas a través de triggers o inclus usando algún nuevo artilugio de Mysql Replication pero leyendo tu post enseguida se me vino a la mente esto:
1.- Con tu lenguaje de programación coloca tu listado de BD en un arreglo aData
2.- Utiliaza el areglo para el ALTER TABLE como se ve a continuación:
FOR x=1 TO LEN(aData)
ALTER TABLE Tabla ..... aData[x,1]
NEXT x
Espero que se entienda la idea. Es muy fácil de implementar y resuele tu problema de raíz... Y desde mi punto de vista lo más importante te permite ejecutarlo solo cuando estas totlmente seguro (con un trigger o replicación apenas metas el cambio este se replicará)
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Ing. Jesús Alfredo Uzcanga
Twitter: @JesusUzcanga
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