Salut,
la doc n'est pas très claire sur ce point, mais il semble que la condition doit suivre la table concernée, à tester bien entendu, je n'ai jamais utilisé cette option, mais si la même condition s'applique sur les deux tables, il faut faire suivre chaque table indiquée dans la commande de l'option -w avec la condition à appliquer.
La commande devrait alors ressembler à quelque chose comme ceci :
"C:\...\MySQL\bin\mysqldump.exe" -u root --skip-add-drop-table -r createTable --port=3306 maBase mod_bi_time -w "id < 10" mod_bi_metricdailyvalue -w "time_id < 10"
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Une question bien formulée, c'est un problème bien compris : ça représente déjà les 3/4 de la réponse ;)