Degradación de Base de Datos

[Rafael Comino]

Tengo una web montada con Typo3 y MySQL.
El caso es que tiene un rendimiento aceptable, pero en cuanto pasan un par de horas, el rendimiento de la página decae muchisimo.
Optimizo entonces las tablas de mi base de datos MySQL, y el rendimiento vuelve a ser óptimo.
Tengo creados los índices necesarios.
La web tiene del orden de unas 600 visitas al día.
No tengo ni idea que razones puede haber para que el rendimiento de la base de datos decaiga tanto en tan poco tiempo.
Alguien tiene alguna sugerencia o me puede indicar como puedo llegar a dar con el problema.