Hola gorka/Gonzalo,
Con el permiso de Gonzalo, agrego a la lista lo siguiente:
6) Al solo declarar (sin inicializar) la variable "resultado", su valor es NULL. Al concatenar a una cadena el valor NULL, toda la cadena será NULL. Además, personalmente haría un CAST para concatenar un valor de tipo INT, a pesar que MySQL lo hace implícitamente.
7) Confirmo la sospecha de Gonzalo, actualmente no es posible usar variables locales como receptora de una asignación INTO en cadenas preparadas. La manera habitual de asignar el valor a una variable usando INTO (como lo planteas en la cadena preparada) es usar variables definidas de usuario (@var_name), de la siguiente manera:
...
set @s = concat('select inscripcion into @resultado
from afedegi_inscripciones
where char_length(trim(codigo_chip)) > 0 and id_usuario_web = \'', usuario, '\'');
...
if (@resultado is not null) then
...
8) Se recomienda usar "DEALLOCATE PREPARE" luego de ejecutar la cadena preparada.