Algunas recomendaciones:
Lo primero es que debes establecer el valor de innodb_buffer_log_size (algunos recomiendan que sea el 25% del tama;o de innodb_buffer_pool_size)
OJO: Para hacer esto tienes que detener mysqld, borrar /datadir/ib_logfile0 y ib_logfile1 (no te preocupes que no perderas data).
Luego te recomiendo quitar innodb_buffer_pool_instances
Y por ultimo revisa que realmente esta configuracion esta siendo tomada por mysql.
Ejecuta este comando en algun cliente mysql:
SHOW VARIABLES LIKE '%innodb%';
Y fijate de los valores (los muestra en bytes asi que dividelos 2 veces entre 1024 para MB y 3 veces para GB)
NOTA: Recuerda que utilizaras los 6 GB cuando los necesites, no es que va a tomar los 6 GB cada ves que hagas un simple select sencillo.
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Ing. Jesús Alfredo Uzcanga
Twitter: @JesusUzcanga
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