Hola Juan
Específicamente un UPDATE no se puede hacer, sin embargo, puedes lograr que la tabla que la tabla actualice los datos ya existentes para evitar duplicidad y que los nuevos si los inserte. Para este deberás utilizar la sentencia "REPLACE". Ejemplo para LINUX:
LOAD DATA INFILE '/ruta/ruta2/archivo.txt' REPLACE INTO TABLE TABLA1;
Donde archivo.txt es el csv y TABLA1 es la tabla en la que insertas los datos.
Esta sentencia reemplaza datos existentes según el o los KEY de la tabla.
Es decir que para una tabla
campo_key | campo_1 | campo2 | campo3
Con que solo el campo_key se encuentre repetido el hará el replace del registro
Espero que te sirva!!!
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Ing. Jesús Alfredo Uzcanga
Twitter: @JesusUzcanga
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