Rigoberto, este problema ocurre comunmente cuando instalamos Mysql sin ningún tipo de configuración solo haciendo siguiente, siguiente, siguiente, siguiente, finalizar y esperamos que todo salga bien.
Un servidor debe ser configurado - optimizado para prestar los servicios para los que es destinado y en el caso de Mysql entre otras cosas se debe ajustar al rendimiento requerido (performance tuning).
Para este caso puntual te recomiendo que pruebes editando el archivo de configuración my.ini (supongo por la imagen que tu server está en guindous), específicamente las siguientes lineas (probablemente debes agregarlas nuevas)
[mysqld]
max_allowed_packet = 1G
innodb_log_file_size = 2G
innodb_log_buffer_size = 512M
Los valores de 1G, 2G y 512M son valores de ejemplo que se ajusta a una configuración de hardware muy específica y debes ajustarla a tu propio servidor. Puedes leear algo de "mysql performance tuning" en google para mejores referencias.
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Ing. Jesús Alfredo Uzcanga
Twitter: @JesusUzcanga
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